Zavod za vodni promet zalaže se za kontinuirano uvođenje novih i proširenje postojećih nastavnih planova i programa prema potrebama tržišta rada te rad na projektima iz područja tehničkih znanosti, polja tehnologija prometa i transport, grane pomorski i riječni promet. Zavod teži prepoznatljivosti u domaćim i međunarodnim okvirima po izvrsnosti u znanosti i visokom obrazovanju u okviru grane pomorski i riječni promet.
Razvitak Zavoda temelji se na sustavnom prijenosu i primjeni znanja, poticanju mobilnosti te suradnji s domaćim i međunarodnim institucijama.
Nastavni i znanstveno-istraživački rad Zavoda organiziran je kroz rad katedri i rad laboratorija.
Ustrojbene jedinice
Katedra za tehnologiju vodnog prometa
Katedra za tehniku vodnog prometa
Laboratorij za planiranje i modeliranje u vodnom prometu